自体脂肪面部填充的缺点是容易出现出血或者是血肿、感染发炎等。在自体脂肪面部填充的手术过程中，由于医生在操作当中过于粗暴就会伤到皮肤其它组织，造成出血或者是血肿的情况。为了避免这种情况的发生，建议去正规的整形医院做自体脂肪面部填充术。

皮肤出现高低不平或者是不对称是它的缺点之一。由于脂肪存在被身体吸收或者是代谢的可能性，那么局部皮肤就会出现高低不平，或者是不对称的情况。