自体脂肪移植坏处主要包括：有可能造成手术部位凹凸不平，这种情况往往是由于医生注射的脂肪颗粒不够均匀造成的。有可能造成注射部位出现血肿，这往往是由于医生手术时操作不当，对伤口的创伤过大，造成一些淤血堆积在皮下形成的。有可能会出现脂肪钙化的情况，这通常是由于手术后大量的脂肪细胞坏死，但是却没有被人体及时代谢掉形成的。

脂肪填充有可能造成伤口感染，不过这种情况大多是由于手术时选择的医院不够正规，医疗环境不达标造成的；此外，如果手术后注射的脂肪颗粒大量坏死，却没有被人体及时代谢掉，有可能造成填充部位出现脂肪钙化。

脂肪移植需要1-2个小时，手术的时间并不固定，这跟选择的医院有一定关系，有资质的大医院医疗设备更加先进，主治医生的经验更为丰富，需要的时间会更短；此外，手术的时间也跟脂肪移植的部位有关，因为不同的部位手术的难易程度不一样，需要移植的脂肪数量不同，从身体其他部位抽取的脂肪量不同，手术的时间是有差异的。